Sweden Job Openings
Uppsala universitet
Postdoktor inom multi-omik och maskininlärning för precisionsmedicin vid barnleukemi
Uppsala
November 28, 2024
Vi söker nu en driven forskare på postdoktornivå till forskargruppen för molekylär precisionsmedicin vid Uppsala universitets Institution för medicinska vetenskaper, som är verksam vid Biomedicinskt Centrum (BMC).
Institutionen för medicinska vetenskaper är en stor klinisk institution med ca 250 anställda och över 900 personer som är anknutna via Akademiska sjukhuset. Institutionen har en bred forskningsprofil med fyra olika avdelningar, och starka forskargrupper inom en rad områden. Forskningen äger rum i nära anslutning till den kliniska verksamheten vid Akademiska sjukhuset och omfattar såväl grundläggande studier kring sjukdomsorsaker som utveckling och utvärdering av förbättrad diagnostik och nya behandlingsmetoder. Mer om institutionens verksamhet finns på www.medsci.uu.se.
Forskargruppen studerar olika sjukdomar med hjälp av storskaliga genetiska metoder (https://www.uu.se/en/department/medical-sciences/research/research-groups/molecular-precision-medicine). Genom nära samarbete med kliniska forskare vid Akademiska sjukhuset i Uppsala har vår forskargrupp tillgång till unika provsamlingar och klinisk patientinformation. Ett nära samarbete med den nationella infrastrukturen för genomik (National Genomics Infrastructure, NGI) vid Science for Life Laboratory (Sci Life Lab), ger forskargruppen tillgång till nästa generationens sekvenseringsteknologi (https://ngisweden.scilifelab.se/).
Det aktuella projektet fokuserar på analys av blodprover från barn med leukemi, friska kontroller och in vitro-cellmodeller med hjälp av olika omik-tekniker. Det övergripande målet är att ta steget mot precisionsmedicin inom barnleukemi. Vi strävar efter att identifiera cirkulerande biomarkörer som kan särskilja högriskpatienter från patienter med låg risk. Med denna strategi vill vi kunna förkorta kemoterapibehandlingen för lågriskpatienter, samtidigt som vi riktar behandlingen mer specifikt mot högriskgruppen. Vi kommer även att genomföra läkemedelsscreeningar för riktade terapier, där vi testar lovande nya läkemedel som befinner sig i prekliniska och tidiga kliniska prövningar.
Finansierat av det transnationella European Partnership for Personalised Medicine (EP Per Med) är detta projekt ett nära samarbete med ledande forskargrupper inom barnhematologi vid University of Freiburg och Technical University of Munich i Tyskland samt University of Tampere i Finland. Som postdoktor i projektet kommer du att ha en nyckelroll i att integrera och analysera multiomik-data inom konsortiet för att fördjupa förståelsen av barnleukemi på molekylär nivå och bidra till utvecklingen av nya behandlingsstrategier.
Du kommer att ingå i Uppsala universitets forskargrupp för molekylär precisionsmedicin, där forskning fokuserar på både utveckling av nya genomiktekniker och tillämpningen av dessa för kliniskt relevanta frågor inom pediatrisk onkologi. Förutom ett starkt fokus på barnleukemi, erbjuder tjänsten möjligheter att utveckla egna forskningsfrågor inom projektets ramar och att samarbeta med experter inom bioinformatik och molekylärbiologi i en dynamisk och interdisciplinär miljö.
Arbetsuppgifter
- Analysera multiomik-data från pediatriska leukemiprover och in vitro-modeller, inklusive genomik (WGS), transkriptomik (bulk och sc RNA-seq), epigenomik (metyleringsarrayer) och proteomik (Olink Explore PEA) data.
- Utveckla och tillämpa maskininlärningsmodeller för att identifiera sjukdomssubtyper och förutsäga behandlingssvar.
- Samarbeta med barnonkologer, bioinformatiker och beräkningsbiologer, både inom forskargruppen och med våra internationella samarbetspartners.
- Författa vetenskapliga artiklar och presentera projektets resultat på vetenskapliga möten och konferenser.
Doktorsexamen i bioinformatik, beräkningsbiologi, molekylärbiologi eller ett närliggande område eller en utländsk examen som bedöms motsvara doktorsexamen inom något av dessa områden. Examen ska vara uppfyllt senast vid tidpunkten då anställningsbeslutet fattas. Främst bör den komma ifråga som har avlagt examen för högst tre år sedan. Vid beräkning av ramtiden om tre år är utgångspunkten sista ansökningsdag. Om det finns särskilda skäl kan sådan examen ha avlagts tidigare. Med särskilda skäl avses ledighet på grund av sjukdom, föräldraledighet, förtroendeuppdrag inom fackliga organisationer, etc.
- Erfarenhet av storskalig dataanalys och programmering i relevanta språk som Python och R.
- Vana vid att hantera stora dataset i LINUX/UNIX-miljö.
- Erfarenhet av storskalig DNA- eller RNA-sekvensering.
- Utmärkta kommunikations- och samarbetsförmågor.
- Goda muntliga och skriftliga kunskaper i engelska.
- Dokumenterad erfarenhet av proteomikanalys och multi-omik integrering.
- Erfarenhet av att tillämpa maskininlärning på biomedicinska data.
- Stark bakgrund inom immunologi.
Anställningen är tidsbegränsad i två år enligt centralt kollektivavtal, med eventuell möjlighet till förlängning ytterligare högst ett år. Omfattningen är heltid. Tillträde enligt överenskommelse. Placeringsort: Uppsala.
Upplysningar om anställningen lämnas av: Jessica Nordlund (jessica.nordlund@medsci.uu.se)
Välkommen med din ansökan senast den 10 januari 2025 , UFV-PA 2024/3911 .
Uppsala universitet är ett brett forskningsuniversitet med stark internationell ställning. Det yttersta målet är att bedriva utbildning och forskning av högsta kvalitet och relevans för att göra skillnad i samhället. Vår viktigaste tillgång är alla 7 600 anställda och 53 000 studenter som med nyfikenhet och engagemang gör Uppsala universitet till en av landets mest spännande arbetsplatser. Läs mer om våra förmåner och hur det är att jobba inom Uppsala universitethttps://uu.se/om-uu/jobba-hos-oss/ Anställningen kan komma att säkerhetsprövas. Vid säkerhetsprövning är en förutsättning för anställning att sökande blir godkänd. Vi undanber oss erbjudanden om rekryterings- och annonseringshjälp. Ansökan tas emot i Uppsala universitets rekryteringssystem.
Anställningsform: tidsbegränsad anställning | Anställningens omfattning: heltid | Antal lediga befattningar: 1 | Sysselsättningsgrad: 100% | Ort: Uppsala | Län: Uppsala län | Land: Sweden | Referensnummer: UFV-PA 2024/3911 | Facklig företrädare: Seko Universitetsklubben seko@uadm.uu.se, ST/TCO tco@fackorg.uu.se, Saco-rådet saco@uadm.uu.se, | Publicerat: 2024-11-29 | Sista ansökningsdag: 2025-01-10
New Job Alerts
Micro-Star Netherlands Holding B V Sweden Bran
Marketing Specialist
Gothenburg
FULL TIME
December 4, 2024
View Job Description
Värmdö kommun
Timanställd Undersköterska till Djurö hemtjänst
Värmdö
December 4, 2024
View Job Description
Håbo Kommun
Ny kollega till boendestöd och sysselsättning sökes
FULL TIME
December 4, 2024
View Job DescriptionSimplified Recruitment Sweden AB
Kyltekniker till Schneider Electric i Falun!
Mora
FULL TIME
December 4, 2024
View Job Description
AFRY
Elektronikutvecklare till AFRY Connected Products i Linköping!
Linköping
December 4, 2024
View Job DescriptionMicro-Star Netherlands Holding B V Sweden Bran
Account Manager
Gothenburg
FULL TIME
December 4, 2024
View Job DescriptionSvenska Rymdaktiebolaget
President Science Services Division
Stockholm
FULL TIME
December 4, 2024
View Job Description
Gate Gourmet Sweden AB
Lastare Gategourmet, Landvetter
Härryda
FULL TIME & PART TIME
December 4, 2024
View Job Description
Eurocon Engineering AB
Uppdragsledare / Projektingenjör inom El till Sundsvall
Sundsvall
FULL TIME
December 4, 2024
View Job DescriptionLooking for similar job?
Karolinska Institutet (KI)
Postdoktor i klinisk smärtforskning
Solna
November 29, 2024
View Job Description
Karolinska Institutet (KI)
Postdoktor inom kostintervention
Stockholm
November 29, 2024
View Job Description
Karolinska Institutet (KI)
Postdoktor i ett translationellt projekt om Alzheimer-patologier
Solna
November 29, 2024
View Job Description
KTH Royal Institute of Technology
Postdoktor i polymernedbrytning och mikroplaster
Stockholm
November 29, 2024
View Job Description
Karlstads universitet
Postdoktor i biologi med fokus på ekologisk modellering av strömfiskpopulationer
Karlstad
November 28, 2024
View Job Description
Lunds universitet
Postdoktor inom vulkanisk påverkan på stratosfären och jordens klimat
Lund
November 28, 2024
View Job DescriptionSee What’s New: Uppsala universitet Job Opportunities
Uppsala universitet
Forskare i utbildningssociologi
Uppsala
FULL TIME
December 4, 2024
View Job Description
Uppsala universitet
Säsongsanställd museiassistent
Uppsala
PART TIME
December 4, 2024
View Job Description
Uppsala universitet
Universitetslektor i didaktik med inriktning mot svenskämnets didaktik
Uppsala
December 4, 2024
View Job Description
Uppsala universitet
Postdoktor inom molekylär evolution
Uppsala
December 3, 2024
View Job Description
Uppsala universitet
Postdoktor i Hierarkisk federerad inlärning för 6G-kantberäkningar
Uppsala
December 3, 2024
View Job DescriptionNew Job Alerts
Micro-Star Netherlands Holding B V Sweden Bran
Marketing Specialist
Gothenburg
FULL TIME
December 4, 2024
View Job Description
Värmdö kommun
Timanställd Undersköterska till Djurö hemtjänst
Värmdö
December 4, 2024
View Job Description
Håbo Kommun
Ny kollega till boendestöd och sysselsättning sökes
FULL TIME
December 4, 2024
View Job DescriptionSimplified Recruitment Sweden AB
Kyltekniker till Schneider Electric i Falun!
Mora
FULL TIME
December 4, 2024
View Job Description
AFRY
Elektronikutvecklare till AFRY Connected Products i Linköping!
Linköping
December 4, 2024
View Job DescriptionMicro-Star Netherlands Holding B V Sweden Bran
Account Manager
Gothenburg
FULL TIME
December 4, 2024
View Job DescriptionSvenska Rymdaktiebolaget
President Science Services Division
Stockholm
FULL TIME
December 4, 2024
View Job Description
Gate Gourmet Sweden AB
Lastare Gategourmet, Landvetter
Härryda
FULL TIME & PART TIME
December 4, 2024
View Job Description
Eurocon Engineering AB
Uppdragsledare / Projektingenjör inom El till Sundsvall
Sundsvall
FULL TIME
December 4, 2024
View Job Description